La forteresse actuelle fut achevée par les Vénitiens en 1579. Son nom antique “Stinalonde” devint plus tard “Spinalonga”, du nom Venitien de l’îlot aujourd’hui appelé “Giudecca”.
Etant donnée l’ importance stratégique de sa position, les Vénitiens conservèrent le fort jusqu’en 1715, plus de 50 ans après la conquête de la Crète par les Ottomans.
Un village peuplé de Turcs, disposant d’ une administration autonome, s’y développa jusqu’ à la fin du 19è siècle. Lorsque les résidents turcs quittèrent les lieux en 1903, les Autorités Crětoises décidèrent d’ isoler les malades souffrants de la lèpre et de les installer sur l’ îlot. Un hôpital y fut Créé en Vue de faciliter la prise en charge de ces maladies.
La vie difficile et les souffrances des lépreux qui Vécurent dans ce lieu jusqu’ en 1957, y ont laissé une forte empreinte émotionnelle, qui fait de cet îlot, un lieu de mémoire.
